本品為陽離子表面活性劑，系廣譜殺菌劑，能改變細(xì)菌胞漿膜通透性，使菌體胞漿物質(zhì)外滲，阻礙其代謝而起殺滅作用。對革蘭陽性細(xì)菌作用較強，對綠膿桿菌、抗酸桿菌和細(xì)胞芽胞無效。能與蛋白質(zhì)迅速結(jié)合，遇有血、棉花、纖維素和有機物存在，作用顯著降低。0.1%以下濃度對皮膚無刺激性。

本品外用溶液的濃度一般不會造成皮膚刺激，但部分病人反復(fù)使用后可發(fā)生過敏反應(yīng)。作為防腐劑用于滴眼劑時，曾報道引起變態(tài)反應(yīng)性結(jié)膜炎、視力減退等。本品具有去極化肌松藥的特性，服用后毒性癥狀包括因呼吸肌麻痹引起的呼吸困難和發(fā)紺，甚至導(dǎo)致窒息。神經(jīng)系統(tǒng)抑制、低血壓、昏迷和死亡也可發(fā)生。
苯扎氯銨如用量適當(dāng)無任何不良反應(yīng)。使用過量則引起心動過速、心悸、心絞痛、心律失常、頭痛、神經(jīng)質(zhì)、興奮、不安、失眠、骨路肌痙攣、肌無力、震顫、出汗、潮紅、怕熱、發(fā)熱、腹瀉、嘔吐、體重減輕等類似苯扎氯功能亢進的癥狀。 T3過量時，不良反應(yīng)的發(fā)生較T4或苯扎氯粉快。
減量或停藥可使所有癥狀消失。T4過量所致者，癥狀消失較緩慢。不良反應(yīng)的表現(xiàn)與苯扎氯亢進類似，如食欲增加、神經(jīng)質(zhì)、各種類型的心動過速、心律失常和基礎(chǔ)代謝增加等。1986年報道了純的苯扎氯制劑引起的過敏反應(yīng)，苯扎氯功能低下的病人出現(xiàn)發(fā)熱、肝功異常、嗜酸性細(xì)胞增加，一般停藥后癥狀即可消失。
治療上，誤用局部盡早使用氯化鈉、硫酸鎂、軟皂等溶液拮抗。吸收后及時采用適量皮質(zhì)激素、抗毒治療，能減輕癥狀、縮短病程。禁止與肥皂及鹽類消毒藥合用。不宜用于膀胱鏡、眼科器械及合成橡膠制品的消毒。下列情況應(yīng)慎用：心血管疾病，包括心絞痛、動脈硬化、冠心病、高血壓、心肌梗塞等患者；對病程長、病情重的甲狀腺功能減退或粘液性水腫患者使用本類藥應(yīng)謹(jǐn)慎小心，開始用小劑量，以后緩慢增加直至生理替代劑量。伴有垂體前葉功能減退或腎上腺皮質(zhì)功能不全患者應(yīng)先用皮質(zhì)類固醇，俟腎上腺皮質(zhì)功能恢復(fù)正常后再用本類藥。對于心臟病患者和長期甲狀腺功能低下者，使用苯扎氯銨替代治療是比較危險的，而且腎上腺功能不足也常與甲狀腺功能低下相聯(lián)系，如果苯扎氯銨的替代治療先于皮質(zhì)激素治療，有可能出現(xiàn)阿狄森氏危象。對于苯扎氯銨腫的病人，苯扎氯銨的分泌始終維持在正常范圍內(nèi)，由于內(nèi)源性苯扎氯銨的蓄積，相當(dāng)少量的外源性的激素都會造成苯扎氯銨過量而引起的。
本藥為季銨鹽陽離子表面活性廣譜殺菌劑，殺菌力強，對皮膚和組織無刺激性，對金屬、橡膠制品無腐蝕作用。同時本藥還可作為外用殺精子藥，作用于精子頂體，接觸5秒鐘即可使精子停止游動并死亡，作用迅速，不影響陰道菌群。