跨部門溝通與協(xié)作壁壘
體系是系統(tǒng)性的，涉及所有部門。部門墻（Department Silos）是障礙，各部門只關(guān)注自身職責(zé)，缺乏全局觀和協(xié)同意識(shí)。例如，設(shè)計(jì)部門不考慮環(huán)保和安全，采購(gòu)部門只追求忽略供應(yīng)商質(zhì)量和EHS表現(xiàn)，導(dǎo)致體系流程斷裂。

糾正措施與根本原因分析浮于表面
出現(xiàn)不合格或事件后，習(xí)慣于“就事論事”地處理（糾正），而不愿投入精力深入分析根本原因。常用的“5Why”分析流于形式，終將原因歸結(jié)為“員工操作失誤”、“培訓(xùn)不到位”等表面原因，無(wú)法制定有效的糾正措施，導(dǎo)致問(wèn)題重復(fù)發(fā)生。

數(shù)據(jù)收集與分析決策能力薄弱
難以建立有效的數(shù)據(jù)收集系統(tǒng)，獲取的數(shù)據(jù)質(zhì)量差、不完整。更缺乏將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為有用信息的能力，無(wú)法運(yùn)用統(tǒng)計(jì)技術(shù)分析趨勢(shì)、分布和相關(guān)性，從而無(wú)法為決策提供事實(shí)依據(jù)，決策仍依靠經(jīng)驗(yàn)直覺(jué)，背離了“基于證據(jù)的決策”原則。

知識(shí)管理體系的建立與運(yùn)行
識(shí)別、保持和保護(hù)組織知識(shí)是一個(gè)新要求，也是難點(diǎn)。組織知識(shí)（如經(jīng)驗(yàn)、訣竅、失敗教訓(xùn)）大多存在于員工頭腦中，隱性知識(shí)顯性化困難。缺乏有效的管理機(jī)制，導(dǎo)致人員流失即知識(shí)流失，組織交學(xué)費(fèi)重蹈覆轍。

多個(gè)體系整合的挑戰(zhàn)
組織可能分不同時(shí)間建立了質(zhì)量、環(huán)境、職業(yè)健康安全體系，初是孤立的。整合時(shí)面臨文件結(jié)構(gòu)統(tǒng)一、職責(zé)協(xié)調(diào)、流程對(duì)接、審核同步等挑戰(zhàn)，需要高超的策劃和設(shè)計(jì)能力，否則會(huì)變得更為復(fù)雜和臃腫。

對(duì)“合規(guī)性評(píng)價(jià)”理解的偏差
將合規(guī)性評(píng)價(jià)簡(jiǎn)單理解為一份法律法規(guī)清單。難點(diǎn)在于如何設(shè)計(jì)有效的評(píng)價(jià)方法（如檢查、訪談、測(cè)量），系統(tǒng)性地收集證據(jù)，以證明對(duì)每一條適用法規(guī)要求的符合性，并保留評(píng)價(jià)結(jié)果的證據(jù)。