目前，國內(nèi)現(xiàn)有的一些畜禽糞便發(fā)酵技術(shù)普遍存在著發(fā)酵，遠距離運輸，集中處理高成本的問題。同時因為發(fā)酵工藝落后，占地面積大，發(fā)酵過程中因發(fā)酵工藝落后造成地下水的污染和因發(fā)酵不全產(chǎn)生的氣味，使蚊蠅滋生對周圍環(huán)境產(chǎn)生嚴重影響。同時發(fā)酵生產(chǎn)受氣候影響嚴重，雨雪天無常工作，冬季因低溫導(dǎo)致設(shè)備無法處理糞便的現(xiàn)象。發(fā)酵時間普遍長達1-2個月，耗費工作人員數(shù)量多。

原始自然堆漚發(fā)酵，此種方法缺點比較多：
1. 發(fā)酵持續(xù)時間長，大約要在300天以上，延遲了羊糞的使用吋間，而且大量占用土地， 造成土地資源浪費；
2. 堆漚的過程中造成污染，
其氣污染.堆漚過程中，發(fā)酵期間會出現(xiàn)惡臭味， 一方面影響大氣質(zhì)量，對周邊大 氣造成污染，另一方面影響周邊居民生活環(huán)境，危害身體健康。
其二水體污染.羊糞堆漚發(fā)酵過程中產(chǎn)生的各種有害病菌易隨地表水流入地下水源，造成地表水和地下水雙層污染，對工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)都會造成危害。
其三環(huán)境污染.堆漚過程中，促使蚊蠅滋生，傳播疾病，對人類生活特別不利。

目前，化肥被大量施用以保持農(nóng)林業(yè)高產(chǎn)。但是，隨著化肥用量不斷增加，土壤開始板結(jié)，化肥淋入地下水也將造成水污染。近年來，我國提倡有機農(nóng)業(yè)，大量應(yīng)用有機肥，達到保持作物產(chǎn)量的同時，保護土地和環(huán)境。畜禽糞便是有機肥重要來源，2016年我國僅養(yǎng)殖肉牛產(chǎn)生的牛糞就達到15萬噸以上，為我國有機肥生產(chǎn)提供了充足的原料。另外，我國小麥歷年種植面積為我耕種地總面積的22％～30％，產(chǎn)生大量小麥秸稈，秸稈為養(yǎng)殖業(yè)提供飼料，也為有機肥生產(chǎn)提供了豐富原料。但是，豐富的原料只是生產(chǎn)的基礎(chǔ)，重要的是對這些原料的加工利用。其中關(guān)鍵的是有機肥原料的發(fā)酵腐熟技術(shù)不斷發(fā)展與創(chuàng)新。