常年自燃的煤矸石山，每平方米燃燒面積將向大氣排放約10.8g CO、約 6.5g SO2、約2g HgS和NOx。除此以外，煤矸石自燃還會產(chǎn)生許多嚴重危害環(huán)境的多環(huán)芳怪類有機污染物，如苯并芘、二苯并蒽、苯并熒蒽、二苯并熒蒽等;它們以氣相形式或吸附于微細粉塵煙塵排人大氣，從而加劇大氣污染;特別是苯并芘具有強的致癌性。這些有害氣體的排放不僅降低了煤矸石山周圍的環(huán)境空氣質(zhì)量，影響周圍居民的身體健康，還會影響周圍的生態(tài)環(huán)境，使樹木生長緩慢、病蟲害增多，農(nóng)作物減產(chǎn)、甚至死亡。

物理污染是指雨水將煤矸石堆上的細粒沖刷下來，形成黑色淤泥細流進入河道湖泊，導(dǎo)致河道湖泊的淤積，使河床抬高、通航能力下降、行洪能力減弱、調(diào)蓄能力降低、水體嚴重污染、直接影響生產(chǎn)生活。為了疏浚河道湖泊、改善水環(huán)境，國家每年都要投入大量的人力、財力和物力。

煤矸石淋溶液不僅污染煤矸石堆積區(qū)，還會通過各種水力聯(lián)系（導(dǎo)水砂層、地層裂隙.農(nóng)灌、河流等）發(fā)生污染轉(zhuǎn)移，從而大范圍地影響工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)，特別是水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)受到危害更重。其中，毒性大的鉛、鎘、汞、砷、鉻能在食物鏈中逐漸富集，后進人人體，對人體健康產(chǎn)生長遠的不良影響，會引起急性、慢性中毒。