原料藥根據(jù)它的來源分為化學(xué)合成藥和天然化學(xué)藥兩大類。
1、化學(xué)合成藥又可分為無機(jī)合成藥和有機(jī)合成藥：無機(jī)合成藥為無機(jī)化合物(極個(gè)別為元素)，如用于治療胃及十二指腸潰瘍的氫氧化鋁、三硅酸鎂等；有機(jī)合成藥主要是由基本有機(jī)化工原料，經(jīng)一系列有機(jī)化學(xué)反應(yīng)而制得的藥物（如阿司匹林、氯霉素等）；
2、天然化學(xué)藥按其來源，也可分為生物化學(xué)藥與植物化學(xué)藥兩大類?？股匾话阆涤晌⑸锇l(fā)酵制得，屬于生物化學(xué)范疇。近年出現(xiàn)的多種半合成抗生素，則是生物合成和化學(xué)合成相結(jié)合的產(chǎn)品。原料藥中，有機(jī)合成藥的品種、產(chǎn)量及產(chǎn)值所占比例大，是化學(xué)制藥工業(yè)的主要支柱。原料藥質(zhì)量好壞決定制劑質(zhì)量的好壞，因此其質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)要求很嚴(yán)，對(duì)于其廣泛應(yīng)用的原料藥都制訂了嚴(yán)格的國家藥典標(biāo)準(zhǔn)和質(zhì)量控制方法；

有機(jī)農(nóng)藥進(jìn)入土壤后通過各種途徑進(jìn)行遷移轉(zhuǎn)化，如揮發(fā)、擴(kuò)散、吸附、生物降解、光解、水解、化學(xué)氧化等。揮發(fā)、擴(kuò)散和吸附過程都不改變農(nóng)藥的化學(xué)結(jié)構(gòu)，主要起著稀釋和降低急性毒性作用;其他幾種過程使農(nóng)藥的化學(xué)結(jié)構(gòu)發(fā)生了改變，總的趨勢是簡單化和化，能終使農(nóng)藥從環(huán)境中消除。

各種植物性農(nóng)藥通常不是單一的一種化合物，而是植物有機(jī)體的全部或一部分有機(jī)物質(zhì)，成分復(fù)雜多變，但一般都包含在生物堿、糖苷、有毒蛋白質(zhì)、揮發(fā)性香精油、單寧、樹脂、有機(jī)酸、酯、酮、萜等各類物質(zhì)中。從廣義上講，富含這些高生理活性物質(zhì)的植物均有可能被加工成農(nóng)藥制劑，其數(shù)量和物質(zhì)類別豐富，是國內(nèi)外備受人們重視的第三代農(nóng)藥的藥源之一。