利用木瓜蛋白酶的酶促反應，可把食品中大分子的蛋白質水解成易于吸收的小分子肽或氨基酸，***適用于如：雞、豬、牛、海產品、血制品、大豆、花生等動植物蛋白酶解、肉類嫩化劑、酒類澄清劑、餅干松化劑、面條穩(wěn)定劑、保健食品、醬油釀造及酒類發(fā)酵劑等，即可提高食品的營養(yǎng)價值，又可降***。

裂餅、碎餅率降低，餅形端正飽滿不縮身，花紋清晰，餅面光滑；并且可以相應減少10％-25％的焦亞硫酸鈉，從而減少SO2等有害物質的殘留量，還可以矯正化學添加劑對餅干風味的影響，有效提高餅干產品的質量。

羊毛的防縮：用木瓜蛋白酶處理過的羊毛，其抗張度比常規(guī)方法高，毛線手感柔軟，舒適、抗收縮、抗張強度等效果收縮性為0；還可用于蠶的脫膠和蠶絲的精煉。

利用木瓜蛋白酶制成皮的脫毛劑，鞣制皮革，經本品鞣制的皮革，毛孔細致光亮。分解飼料中蛋白質成氨基酸，增加營養(yǎng)物質的滲出量，利于家禽對蛋的吸收和利用，同時補充動物內源酶不足，提高飼料利用率及降低飼料***，增強食欲，進而促進動物生長，提高日增重及成活力，還可以作為蔬菜水果復合肥料的添加劑。

此外還可加入加牙膏、漱口水、牙粉等,可清潔口腔，除去牙垢和牙結石，與其它溶劑配合可制成隱形眼鏡的清潔消毒劑以及感光膠片銀的回收等。

反應溫度50—55℃，溫度因底物的種類及濃度不同而有所改變；適宜PH值6—7，PH可因底物的種類、濃度不同而有所改變；添加量一般為0.1—0.3%(1000—3000u/g蛋白質)，根據(jù)不同底物作適當增減，反應時間作相應縮短或延長。