然而，對于原始生產(chǎn)者來說，要實(shí)現(xiàn)碳減排的氣候目標(biāo)還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。根據(jù)國際能源機(jī)構(gòu)的報(bào)告，為了實(shí)現(xiàn)可持續(xù)發(fā)展目標(biāo)，到2030年，運(yùn)輸生物燃料的生產(chǎn)需要確保每年增長10%。2019年的增長率僅為6%，國際能源署預(yù)測，未來五年的平均產(chǎn)出增長率僅為3%。

全球每年產(chǎn)生大量廚房廢油，但由于來源分散，回收難度加大。據(jù)統(tǒng)計(jì)，原材料收集成本占生物燃料成本的70%-80%。然而，木本油料植物受季節(jié)影響，難以維持可持續(xù)供應(yīng)。糧食原料存在著“人爭糧”、“人爭地”的問題?，F(xiàn)有油料作物不符合生長周期短、含油量高的特點(diǎn)。

進(jìn)口原材料受天氣、國際市場變化等因素影響。今年以來日益的全球糧食危機(jī)對國際生物燃料產(chǎn)生了直接影響。生產(chǎn)工藝不成熟?，F(xiàn)有成熟工藝存在著燃料穩(wěn)定性不夠或潤滑性差等缺點(diǎn)。

產(chǎn)品成本高。以生物航空燃料為例，其成本是石油航空煤油的數(shù)倍，在成本上沒有競爭優(yōu)勢。雖然航空公司也會購買一定數(shù)量的生物航空燃料，但考慮到成本，購買量不會很大。此外，成品油的生產(chǎn)還將產(chǎn)生外部間接成本。

即所有轉(zhuǎn)化過程將不可避免地導(dǎo)致新的污染源，包括二氧化碳和其他污染物的排放；如果煉油后的廢渣，特別是煉油廢油的廢渣處理不當(dāng)，也會造成污染，治理污染的成本終會增加到成品油的價(jià)格中。

此外，可以制定政策，引導(dǎo)消費(fèi)者積極參與生物燃料的使用。歐盟航空公司開發(fā)了碳排放交易系統(tǒng)，并為航空公司規(guī)定了碳排放配額。在該系統(tǒng)中，以2004年至2006年往返歐盟的航空公司的年平均碳排放量作為該航空公司的排放基線。