STEM探測器和經(jīng)典的極靴下背散射電子探測器類似，一般也采用半導(dǎo)體材質(zhì)，并分割為好幾塊，
其中一塊位于樣品的正下方，主要用于接收正透過樣品的透射電子，即所謂的明場模式；還有的位于明場探測器的周圍，接收經(jīng)過散射的透射電子，即所謂的暗場模式。

激光掃描共聚焦顯微鏡是在傳統(tǒng)熒光顯微鏡成像的基礎(chǔ)上采用激光作為光源，通過使用激光掃描裝置和共軛聚焦裝置，利用計算機對所觀察的對象進行數(shù)字圖像處理的現(xiàn)代化光學(xué)顯微鏡。它能以的分辨率采集細胞或組織內(nèi)部的熒光標(biāo)記圖像、觀察細胞或組織內(nèi)部的微細結(jié)構(gòu)和形態(tài)學(xué)變化、在亞細胞水平觀察胞內(nèi)重要離子濃度或 pH 的變化、結(jié)合電生理技術(shù)觀察和記錄細胞的生理活動。使用激光掃描共聚焦顯微鏡，還可以對觀察樣品進行斷層掃描和成像、重構(gòu)和分析細胞的三維空間結(jié)構(gòu)。

掃描電鏡除能檢測二次電子圖像以外，還能檢測背散射電子、透射電子、特征x射線、陰極發(fā)光等信號圖像。其成像原理與二次電子像相同。在進行掃描電鏡觀察前，要對樣品作相應(yīng)的處理。
對樣品的要求
1、不會被電子束分解
2、在電子束掃描下熱穩(wěn)定性要好
3、能提供導(dǎo)電和導(dǎo)熱通道
4、大小與厚度要適于樣品臺的安裝
5、觀察面應(yīng)該清潔，物
6、進行微區(qū)成分分析的表面應(yīng)平整
7、磁性試樣要預(yù)先去磁，以免觀察時電子束受到磁場的影響