人們對瑪瑙質量和經(jīng)濟價值的評判，一般都是以肉眼識別作為主要手段，盡管現(xiàn)代科學技術發(fā)達，各種玉石鑒定儀器很多，但在交易過程中使用這些儀器一是很不方便，二是不能解決問題，原因很簡單，會受到環(huán)境的局限，若判斷瑪瑙的優(yōu)劣及經(jīng)濟價值，那儀器就毫無用途了。交易現(xiàn)場不可能進行復雜儀器作業(yè)，所以肉眼鑒別始終是一種極其重要的方法。瑪瑙種類繁多，素有“千樣瑪瑙萬種玉”之說，所以鑒別方法也很多，通常以紋帶、顏色、透明度、裂紋、雜質、砂心和塊重為分級標準，除水膽瑪瑙為珍貴外，一般以搭配和諧的俏色原料為佳品。

古代瑪瑙開采、加工生產(chǎn)力及其低下，瑪瑙礦石硬度高、開采難度大，在沒有電動工具的“砣鋸時代”，有“一砣瑪瑙一砣金”的說法。象形圖紋瑪瑙形成本身具有偶然性，原石橫切、豎切、斜切，多切少切哪怕是差一毫米，就會與瑪瑙圖案失之交臂，可謂“失之毫厘，謬之千里”，這些原因導致了象形圖紋瑪瑙實物更是存世。中華民族自古又多災多難，歷經(jīng)多次戰(zhàn)亂、社會動蕩，由古傳至今的象形圖紋瑪瑙實物，真是鳳毛麟角。全世界只有中國的故宮博物院和俄羅斯的克林姆林宮寶石博物館偶能發(fā)現(xiàn)有“色彩成圖的瑪瑙”。

按包裹體分類：

南紅瑪瑙：主要產(chǎn)自云南保山、四川涼山和外蒙古等地。其中，涼山的南紅品質，少裂且色澤艷麗；而保山南紅的膠質感強，油潤度高。
戰(zhàn)國紅瑪瑙：以遼寧朝陽的北票料和河北宣化料為主，前者更佳。其特點為紅色和黃色兩種顏色發(fā)暗并多拉絲結構。
苔蘚瑪瑙或苔紋瑪瑙：內(nèi)部含有樹枝狀或苔蘚狀花紋，常見有水草瑪瑙和櫻花瑪瑙等品種。